تحلیل پایداری شبکه های تنظیم ژنی پرش مارکف
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس
- نویسنده محمد محمدیان
- استاد راهنما حمید رضا مومنی
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1390
چکیده
از آن جا که تنها تعداد کمی مولکول در تنظیم ژن ها شرکت می کنند، شبکه های تنظیم ژنی نسبت به نویز بسیار حساس هستند. همچنین به دلیل آهستگی واکنش های زیست شیمیایی و جابجایی های مولکولی، شبکه های ژنی دارای تأخیر هستند. در این پایان نامه، با در نظر گرفتن شبکه های ژنی با نویزهای جمع شونده ی غیر صفرشونده، شرایط کافی برای همگرایی نمایی به نقطه ی تعادل و کرانداری نهایی در این شبکه ها را به دست می آوریم. به کمک تابعی لیاپانوف- کراسوفسکی مناسب، شرایط کران داری نهایی به صورت نامساوی های ماتریسی ارائه شده اند. در ادامه، روشی برای به دست آوردن واریانس غلظت پروتئین ها و mrnaها در حضور نویز ذاتی ارائه می شود. برخلاف روشهای موجود، روش پیشنهادی را می توان برای شبکه های ژنی با جمله های غیرخطی نیز به کار برد. در این روش از برنامه نویسی مجموع مربعات استفاده شده است. در پایان، به بررسی پایداری و تضعیف اغتشاش در شبکه های تنظیم ژنی پرش مارکفی با تأخیر متغیر با زمان و وابسته به مود می پردازیم . شرایط پایداری این دسته از سامانه ها نیز به صورت نامساوی های ماتریسی خطی ارائه شده اند و به کران پایین و بالای تأخیر در هر مود وابسته اند.
منابع مشابه
تحلیل پایداری شبکه های تنظیم ژنی
در این پایان نامه مسأله پایداری شبکه های تنظیم ژنی مورد بررسی قرار می گیرد. ابتدا شرایط پایداری تصادفی مقاوم را برای یک مدل گسترش یافته از شبکه ژنی که دارای نویز و هر دو نوع تأخیرهای گسسته و توزیع شده است در mrna و نیز پروتئین است بدست آورده شده است. سپس، برای مدل جدیدتری که در آن متغیرهای تأخیر یافته- به جای خود متغیرها- در تابع تنظیم ژنی بکار گرفته شده است تحلیل پایداری انجام می گیرد. با استف...
15 صفحه اولکاربرد مدل مارکف پنهان در تحلیل نواحی ژنی و بین ژنی توالی dna
مدل های مارکوف پنهان دسته ای از فرایندهای تصادفی هستند که در مسائل کاربردی بسیار متنوعی با موفقیت به کار رفته اند. در این پایان نامه، مباحث مربوط به مدل احتمالی مارکوف پنهان در رابطه با مسأله ژن یابی در توالی های dna ارائه گردیده است. ژن ها قسمت هایی از dna می باشند که توانایی سنتز پروتئین ها را دارند. بنابراین ژن یابی مرحله بسیار حساسی در تحلیل داده های توالی dna است.
15 صفحه اولشبکه های بیان ژنی برای آنالیز داده ماکرواری DNA
بر خلاف دیدگاه تقلیل گرایانه بیولوژی کلاسیک ، رویکرد کل نگر در بیولوژی با انفجار در پیشرفت تکنیک هایی با تکنولوژی بالا و تولید حجم عظیم داده خود را نشان داده است . اکنون چالش بیولوژیست ها کشف روش های تحلیل این داده ها است تا بتوانند در رسیدن به درک سیستم پویای پیچیده حیات کمک کنند. در بین تکنولوژی های بسیار پیشرفته اخیر که بیشترعمومی هستند میکرواری DNA از مشهورترین آن ها است . میکرواری،سطوح بیا...
متن کاملیک الگوی چند متغیری بیزی برای شبکه های ژنی
روش های استنباط متعددی برای شبکه های ژنی وجود دارد، ولی در همه آن ها تنها از اطلاعات نمونه استفاده می شود و کمتر مواردی وجود دارد که از اطلاعات گذشته یا اطلاعات موازی استفاده شده باشد. در این پژوهش به استنباط بیزی شبکه های ژنی پرداخته می شود. تلاش می شود از اطلاعات موجود در قالب یک الگوی بیزی استفاده شود. بدیهی است با به کارگیری توزیع پیشین مناسب و توجه به عدم استقلال پارامترهای موجود در شبکه ه...
متن کاملکاربرد شبکههای تلفیقی به منظور برازش شبکه تنظیم بیان ژنی مؤثر بر رشد ماهیچه اسکلتی در گاو
فناوری توالییابی رونوشتهای سلولی ابزار قدرتمندی در جهت تجزیه و تحلیل رونوشتهای سلولی، در بسیاری از زمینههای تحقیقاتی میباشد. در سالهای اخیر پیادهسازی شبکه جهت بررسی روابط بین ژنها با استفاده از دادههای حاصل از این فناوری به درک بهتر سازوکارهای پیچیده فیزیولوژیکی کمک نموده است. در این مطالعه به ساخت شبکه تنظیم بیان ژن و مطالعه روابط بین ژنهای دخیل در تشکیل و رشد بافت ماهیچه اسکلتی به ک...
متن کاملمدلسازی شبکه های تنظیم کننده ژنی با استفاده از داده های سری زمانی میکروآرایه
تعاملات بین ژن ها، پروتیین ها و مواد دیگر در سلول، تشکیل یک شبکه ی پیچیده می دهند که نقش مهمی در عملکرد درست سلول بازی می-کند. مدلسازی شبکه های ژنی می تواند در زمینه های مختلف مانند شناسایی بیماری های ژنتیکی، انتخاب کاندیداهای ژن درمانی و به دست آوردن ایده هایی در مورد عملکرد ژن های ناشناخته کاربرد داشته باشد. روش آزمایشگاهی میکروآرایه های dna امکان اندازه گیری همزمان بیان هزاران ژن را فراهم می...
15 صفحه اولمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023